Projekcije širjenja COVID19 v Sloveniji

Napoved 10.7.2020

Kot kaže, se je število dnevnih pozitivnih testov že skoraj ustalilo zaradi učinkovanja ukrepov, kar je zelo dobra novica (slika 1). Trend je še rahlo naraščajoč in upamo, da se bo obrnil navzdol, ko bodo prijeli še zadnji sprejeti ukrepi. V tem primeru bo možno nekatere ukrepe sprostiti na račun sprejetja drugačnih ukrepov (ključno je, da je efektivno reprodukcijsko število manjše od 1). V prihodnjih tednih bo število dnevnih pozitivnih testov predvidoma fluktuiralo v območju od 10 do 30.

Kaže (slika 2 in slika 3), da je bila v zadnjem obdobju rast v Sloveniji že posledica eksponentne rasti števila notranjih okužb in ne več posledica eksponentne rasti uvoženih okužb.

Efektivno reprodukcijsko število ocenjujemo na 1,7. Efektivno reprodukcijsko število ob prevladi dinamike uvoženih okužb predstavlja grobo oceno reprodukcijskega števila v sosednjih državah.

Pojasnila in podrobnosti

Uvod

Napoved obremenitev epidemiološke službe, Slika 1

Ali v Sloveniji še prevladujejo uvožene okužbe?, Slika 2, Slika 3

Uvod

V juniju smo v Sloveniji ponovno zaznali eksponentno rast števila pozitivnih testov na COVID-19. Pomemben del novih okužb se zgodi v tujini. Okužbe, ki jih takšni posamezniki »uvozijo« v Slovenijo, se potem v osebnih stikih širijo naprej med prebivalci Slovenije. Značilne skupine okuženih so tako lahko družine, sodelavci, sošolci ipd. »uvoženih« bolnikov. 

Obrambo proti širjenju tovrstnih okužb opravlja epidemiološka služba NIJZ. Njeni sodelavci ob pozitivnem testiranju posameznikov raziščejo njihove poti in stike v zadnjem tednu ali dveh. Cilj je poiskati vse posameznike, ki so bili v stiku z bolnikom, in jih napotiti v samoizolacijo oz. karanteno. Delovanje epidemiološke službe je z rastjo števila novih okužb vse bolj naporno. Ko bodo njihove zmožnosti presežene, se bo dinamika okuževanja močno povečala.

 Osnovna cilja naših napovedi sta zato:

• Napovedati obremenitve epidemiološke službe za teden ali dva naprej, in
• Oceniti, ali v Sloveniji prevladuje vpliv uvoženih okužb.

Pri oceni, ali v Sloveniji prevladuje vpliv uvoženih okužb, si pomagamo tudi z dvema ocenama reprodukcijskega števila, ki predstavlja število ljudi, ki jih v povprečju okuži vsak izmed okuženih. Naši oceni v nadaljevanju sta v skladu z dvema glavnima viroma okužb (uvoz in širjenje v Sloveniji) definirani kot:

• Reprodukcijsko število (R): število ljudi, ki jih v povprečju v Sloveniji okuži vsak okuženi (ne glede na to, ali je bil uvožen ali je bil okužen v Sloveniji)
• Efektivno reprodukcijsko število: v tem primeru predpostavimo, da uvoženi in okuženi v Sloveniji sodijo v isto skupino (okuženih v Sloveniji).

Ob takšnih definicijah je efektivno reprodukcijsko število vedno večje ali kvečjemu enako (v primeru, da uvoženih ni več) reprodukcijskemu številu. Na osnovi efektivnega reprodukcijskega števila je mogoče oceniti trenutno dinamiko epidemije in napovedati njen razvoj.

Napoved obremenitev epidemiološke službe

Kot kaže, se je število dnevnih pozitivnih testov že skoraj ustalilo zaradi učinkovanja ukrepov, kar je zelo dobra novica (slika 1). Trend je še rahlo naraščajoč in upamo, da se bo obrnil navzdol, ko bodo prijeli še zadnji sprejeti ukrepi. V tem primeru bo možno nekatere ukrepe sprostiti na račun sprejetja drugačnih ukrepov (ključno je, da je efektivno reprodukcijsko število manjše od 1). V prihodnjih tednih bo število dnevnih pozitivnih testov predvidoma fluktuiralo v območju od 10 do 30.

Kaže (več v nadaljevanju), da je bila v zadnjem obdobju eksponentna rast v Sloveniji že posledica eksponentne rasti števila notranjih okužb in ne več posledica eksponentne rasti uvoženih okužb, ki se pomnožijo v zajezenih mikrožariščih.

Slika 1:

Uvoz okužb je mogoče učinkovito nadzirati z zaostritvijo nadzora na mejah.

Ali v Sloveniji še prevladujejo uvožene okužbe?

Uvožene okužbe (in njihovo pomnoževanje v zajezenih mikrožariščih) so prevladovale ves čas od začetka junija, zdaj pa že prevladujejo notranje okužbe. To sklepamo na osnovi analize, ki jo povzemamo v nadaljevanju.

Na sliki 2 z logaritemsko skalo vidimo, da je bila v zadnjem obdobju eksponentna rast pozitivnih testov bistveno hitrejša od (verjetno ne več eksponentne) rasti uvoženih primerov (naklon modre krivulje vseh testov je občutno večji od naklona vijolične krivulje uvoženih primerov), kar kaže tudi razmerje med obema, ki se veča eksponentno (strm naklon rdeče krivulje). Zato predvidevamo, da je v zadnjem obdobju število okuženih rastlo eksponentno zaradi eksponentne dinamike okuževanja znotraj države, ki ni posledica le (morebiti še vedno eksponentne) rasti uvoženih okužb in njihove pomnožitve v zajezenih mikrožariščih.

Slika 2:

Oceni reprodukcijskega in efektivnega reprodukcijskega števila iz dnevnega števila pozitivnih testov sta prikazani na sliki 3. Efektivno reprodukcijsko število ob prevladi dinamike uvoženih okužb predstavlja grobo oceno reprodukcijskega števila v sosednjih državah. Reprodukcijsko število pa ocenjuje prenašanje bolezni v Sloveniji. V obdobju naraščanja uvoženih okužb je precenjeno zaradi začetnega okuževanja v vse večjem številu zajezenih mikrožarišč pred intervencijo epidemiološke službe. Šele ko uvožene okužbe ne naraščajo več, predstavlja reprodukcijsko število realno oceno notranjega prenašanja bolezni. Zato sklepamo, da obe vrednosti precenita trenutno vrednost R v Sloveniji.

Krivulja R (R pove, koliko ljudi v povprečju okuži posamezni okuženi) se vse bolj približuje krivulji efektivnega R (R_ef predpostavlja, da se je uvoženi okuženi okužil preko notranjega okuževanja v Sloveniji), kar potrjuje, da postaja notranje širjenje okužb vse pomembnejše. Ko/če bodo uvožene okužbe postale nepomembne, se bosta krivulji prekrivali. Za zdaj so pomembne tako uvožene okužbe kot notranje širjenje.

Efektivno reprodukcijsko število, ki določa dinamiko širjenja bolezni, ocenjujemo na osnovi 7 dnevnega drsečega povprečja na 1,7. Ker zaradi povprečenja vključuje tudi trende iz preteklosti, je precenjeno. 

Slika 3: